FBI-agent Sean Archer, wil koste wat kost de psychotische terrorist Castor Troy oppakken omdat deze verantwoordelijk is voor de moord op zijn zoontje. Troy blijkt een bom te hebben verborgen die heel Los Angeles zal verwoesten, maar raakt in coma. Archer gaat tot het uiterste om erachter te komen waar de bom zich bevindt en ondergaat een medische ingreep waarbij zijn gezicht wordt verwisseld met dat van Troy. Vervolgens ontwaakt Troy uit zijn coma, ontsnapt uit het ziekenhuis en gaat ervandoor met Archers gezicht.